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媒體報(bào)道

《細(xì)胞》:研究者提出一種用于鑒定CD4+T細(xì)胞表位的基因組規(guī)模平臺

發(fā)布日期:2023年12月1日 閱讀:540

美國布萊根婦女醫(yī)院Stephen J. Elledge團(tuán)隊(duì)近期取得重要工作進(jìn)展,他們研究提出了TScan-II,一種用于鑒定CD4T細(xì)胞表位的基因組規(guī)模平臺。相關(guān)研究成果2023年11月27日在線發(fā)表于《細(xì)胞》雜志上。

據(jù)介紹,CD4T細(xì)胞在協(xié)調(diào)免疫反應(yīng)和組織穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮著重要作用。然而,由于目前無法將多肽人類白細(xì)胞抗原II類(HLA-II)復(fù)合物與其同源T細(xì)胞受體(TCR)較好的聯(lián)系起來,從而阻礙了人們對CD4T細(xì)胞功能和在病理中的功能理解。

研究人員介紹TScan II,一個(gè)高度敏感的基因組CD4+抗原發(fā)現(xiàn)平臺。該平臺無縫集成了合成抗原呈遞細(xì)胞中的內(nèi)源性HLA-II抗原處理機(jī)制和T細(xì)胞中的TCR信號,能夠同時(shí)篩選多種HLA和TCR。TScan II利用基因組規(guī)模的人類、病毒組和表位誘變文庫,促進(jìn)了抗原的從頭發(fā)現(xiàn)和TCR特異性的深入探索。研究人員通過鑒定癌癥活性CD4T細(xì)胞克隆的非經(jīng)典抗原,證明了TScan-II在基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化研究中的潛力。

此外,研究人員鑒定了兩種用于干燥病(Sj?gren’s disease)中克隆擴(kuò)增的CD4T細(xì)胞的抗原,它們結(jié)合不同的HLA,并在受影響唾液腺內(nèi)的HLA II陽性導(dǎo)管細(xì)胞中表達(dá)。

附:英文原文

Title: TScan-II: A genome-scale platform for the de novo identification of CD4T cell epitopes

Author: Mohammad H. Dezfulian, Tomasz Kula, Thomas Pranzatelli, Nolan Kamitaki, Qingda Meng, Bhuwan Khatri, Paola Perez, Qikai Xu, Aiquan Chang, Ayano C. Kohlgruber, Yumei Leng, Ananth Aditya Jupudi, Michelle L. Joachims, John A. Chiorini, Christopher J. Lessard, A. Darise Farris, Senthil K. Muthuswamy, Blake M. Warner, Stephen J. Elledge

Issue&Volume: 2023-11-27

Abstract: CD4T cells play fundamental roles in orchestrating immune responses and tissue homeostasis. However, our inability to associate peptide human leukocyte antigen class-II (HLA-II) complexes with their cognate T cell receptors (TCRs) in an unbiased manner has hampered our understanding of CD4T cell function and role in pathologies. Here, we introduce TScan-II, a highly sensitive genome-scale CD4+ antigen discovery platform. This platform seamlessly integrates the endogenous HLA-II antigen-processing machinery in synthetic antigen-presenting cells and TCR signaling in T cells, enabling the simultaneous screening of multiple HLAs and TCRs. Leveraging genome-scale human, virome, and epitope mutagenesis libraries, TScan-II facilitates de novo antigen discovery and deep exploration of TCR specificity. We demonstrate TScan-II’s potential for basic and translational research by identifying a non-canonical antigen for a cancer-reactive CD4T cell clone. Additionally, we identified two antigens for clonally expanded CD4T cells in Sjgren’s disease, which bind distinct HLAs and are expressed in HLA-II-positive ductal cells within affected salivary glands.



來源:科學(xué)網(wǎng)

原標(biāo)題:一種用于鑒定CD4+ T細(xì)胞表位的基因組規(guī)模平臺

作者:小柯


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